新开药店在报税过程中需要遵循国家税收法律法规,结合自身经营特点完成各项税务申报工作，需在领取营业执照后30日内前往主管税务机关办理税务登记，确定纳税人身份（小规模纳税人或一般纳税人），这直接影响后续计税方法和申报流程，药店的经营范围通常涉及药品销售、可能的中药饮片加工或健康咨询服务，需根据实际业务范围在税务登记时核定税种，主要包括增值税、企业所得税、城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加等，若涉及房产和土地还需缴纳房产税和土地使用税。
增值税申报是药店报税的核心环节,小规模纳税人适用3%征收率（2023年减按1%征收率），按季申报，销售额不含税，可享受月销售额10万元以下（季度30万元以下）免征增值税的优惠政策，一般纳税人适用6%税率（药品销售属于现代服务-生活服务中的医疗辅助服务，或根据具体业务适用不同税率），按月申报，可抵扣进项税额，需取得合规增值税专用发票，药店需注意采购药品、耗材、办公用品等取得的进项发票必须合规，且应在发票开具之日起360天内认证抵扣，销售药品时需向购买方开具发票，普通发票与专用发票需根据购买方需求选择，确保发票内容与实际业务一致，品名、规格、数量、金额等信息准确无误。
企业所得税方面,药店需按季度预缴，年度终了后5个月内汇算清缴，应纳税所得额=收入总额-不征税收入-免税收入-各项扣除-以前年度亏损，收入总额包括药品销售收入、其他业务收入等；扣除项目需符合税法规定，如药品采购成本、员工工资薪金、租金、水电费、广告费和业务宣传费（不超过当年销售（营业）收入15%的部分准予扣除）、业务招待费（按发生额60%扣除，最高不超过当年销售（营业）收入的5‰）等，药店应规范会计核算，建立总账、明细账，准确记录成本费用，留存相关凭证（如采购合同、费用发票、工资表等）备查。
其他税费方面,城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加分别按实际缴纳增值税的7%、3%、2%计算缴纳（小规模纳税人可减半征收），若药店拥有自有经营房产，需从次月起按房产原值减除30%后的余值（1.2%税率）或租金收入（12%税率）缴纳房产税；拥有土地使用权的，按土地面积和适用税额缴纳土地使用税，员工人数超过一定人数还需申报缴纳残疾人就业保障金。
税务申报流程可通过电子税务局线上办理,小规模纳税人增值税按季申报，一般纳税人增值税按月申报，企业所得税按季预缴、年度汇算清缴，申报前需核对销项税额与进项税额，确保应纳税额计算准确；申报后及时缴纳税款，避免逾期产生滞纳金，新开药店还需注意税务变更申报，如经营范围调整、纳税人身份变更等，应在发生变化后30日内向税务机关办理手续。
为降低税务风险,药店应聘请专业会计或委托代理记账机构，确保账务处理和申报准确；定期学习税收政策，充分利用小微企业税收优惠、阶段性减免政策等；加强发票管理，避免虚开发票、未按规定开具发票等违法行为，妥善保管会计凭证、账簿、报表等税务资料，保存期限为10年。
相关问答FAQs：
问：新开药店作为小规模纳税人，季度销售额未超过30万元，是否需要申报增值税？
答：即使季度销售额未超过30万元享受免征增值税优惠，仍需在季度结束后15日内通过电子税务局进行增值税申报，选择“小微企业免税”等相应栏目，填写免税销售额，无需缴纳税款，但必须完成申报流程。
问：药店采购中药材用于饮片加工，取得的农产品收购发票能否抵扣进项税额？
答：可以，但需符合规定：自行收购或购进免税农产品时，应向销售方（或个人）开具农产品收购发票，注明收购金额和农产品名称、数量等，按收购发票买价和9%的扣除率计算进项税额（一般纳税人），且需留存收购凭证、付款凭证等资料备查，确保业务真实合规。
